生物與信息實驗室招收碩士博士研究生公告
發布時間:2017-10-19  閱讀次數:16650

 

專業

導師

研究方向

招港澳臺

招留學生

83500

四方哲也

生命體系的計算機虛擬及實驗建構

招收

招收

軟件工程

 

 

導師簡介

四方哲也(Tetsuya Yomo,日籍),1963年生,華東師范大學(計算機科學與軟件工程學院)特聘教授,博士生導師。

 

四方哲也教授獲大阪大學的學士、碩士以及博士學位,在博士課程期間被遺傳進化理論的歷代十大著名學者之一Susumu Ohno教授邀請前赴美國HOPE研究所任研究員。之后他在大阪大學以及東京大學任職,并成為大阪大學在生命科學和信息科學兩個學院的雙聘教授。經過20多年的研究,他在Nat Biotech,Nat Struc Biol,Nat Commun,Proc Natl Acad Sci USA,Mol Syst Biol,Mol Biol Evo,Nucl Acids Res等前沿雜志上發表論文超過220篇(H指數41),其中近200篇均是以第一作者或者通訊作者身份發表。此外,他主持的科研項目經費累計超過5億人民幣,并獲得日本及國際專利20余項,且都是專利第一人。

   

四方教授是日本前沿尖端交叉學科的第一帶頭人,具有廣泛及扎實的專業基礎和超常的開拓創新能力。他在交叉學科研究中,世界上首次創造了具有自我復制能力的人工細胞,獲國際專家高度評價。四方哲也教授共獲得十多項日本國內外獎項。他作為將人工共生的第一人,被Journal of Molecular Evolution雜志授予Zuckerkandl Prize,并因其在蛋白分子進化方面的杰出貢獻,被日本生物工學會以及Biophysics 雜志授予優秀論文獎,同時也被日本進化學會和生物工學會分別授予年輕科學家獎和齋藤獎。

 

研究方向

1.人造細胞

人造細胞的構建是將多種細胞素包裹在脂質囊泡和乳狀液的細胞大小內,并將其基因復制到細胞大小的區域中進行實驗。人造細胞使它們內部的生化反應和腔室的生長同步。通過連續每天將人工細胞接種到新鮮的培養基中,就好像它們是天然細胞一樣,內部的基因通過達爾文進化進化,以100倍的速度擴增,表現出宿主-寄生蟲類型的振蕩。人工細胞還通過體外篩選進化了膜蛋白。

 

2.細菌適應和進化

單個遺傳背景的細菌細胞群體受到不同的選擇壓力。結果表明,基因表達噪聲驅動的表型多樣性對適應前所未有的環境變化至關重要。通過室內進化觀察共生、寄生、表型變異、饑餓、溫度升高等的演化動態。研究發現,中性突變是固定的,即使在適應度增加的進化過程中也是如此。

 

3.蛋白質進化和模擬

隨機選擇的氨基酸序列被用于突變和選擇的循環。酶活性、蛋白質結合活性和DNA結合活性與某些結構順序共同進化。突變和選擇的周期被從理論上證明是進化了蛋白質結構。

 

實驗室概況:

生物與信息實驗室建于華東師范大學理科大樓B座18樓,擁有兩個普通實驗室、一個微生物實驗室、一個百級凈化室和一個學生活動室,占地約200平方米,造價近1000萬。實驗室配備國際前沿的生物儀器和計算機設備,如超純水儀、冷凍離心機、實時熒光定量、酶標儀、小型智能發酵罐、流式細胞儀、熒光顯微鏡、超低溫冰箱等。

 

實驗室網站地址:http://www.ibis.ecnu.edu.cn/

 

學生要求:

有生物學、化學、計算機背景優先。

有實驗室操作經歷優先。

英語流利者優先。

勤學善問,思維敏捷,熱愛科研。

 

本實驗室歡迎感興趣的本科、碩士、博士生來參觀與學習,將安排團隊專職研究人員介紹與專業學習指導。四方教授目前全職在華東師范大學工作,基本上每天都在實驗室,有較多的時間指導學生。

 

聯系人:

實驗室秘書 史書怡

華東師范大學計算機科學與軟件工程學院

電話 021-62233727

郵箱 [email protected]

華東師范大學軟件工程學院
www.hgmxbc.live Copyright Software Engineering Institute
院長信箱:[email protected] | 院辦電話:021-62232550 | 學院地址:上海中山北路3663號理科大樓
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